Package: boxshade (3.3.1-14 and others)

[ Source: boxshade  ]

Pěkný tisk vícesekvenčních uspořádání

Boxshade je program sloužící k vytváření pěkně vypadajících tiskových sestav z různých uspořádání proteinů a sekvencí DNA. Program neřeší vlastní uspořádání a vyžaduje vstupní soubor, který je vytvořen tímto programem či ručně upraven příslušnými nástroji.

Boxshade čte sekvenční uspořádání ze souborů PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data a ESEE-save (omezených na maximálně 150 sekvencí s maximálně 10000 položkami). Program umí různá stínování na stejné/podobné zbytky. Výstup je možno zobrazovat na obrazovce ve formátech: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT a HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag, Text

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• sug: kalign

  Globální a progresivní nastavení seskupení

  or clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  or mafft

  Program pro uspořádání aminokyselin a sekvencí nukleotidů

  or hmmer

  Markovy modely pro analýzu proteinových sekvencí

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  Facility for Interactive Generation of figures under X11

Download boxshade

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
riscv64	3.3.1-14+b2	52.7 kB	152.0 kB	[list of files]