Package: tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-12)

[ Source: tree-puzzle  ]

Rekonstrukce fylogenetických stromů podle pravděpodobnosti

TREE-PUZZLE (nové jméno PUZZLE) je interaktivní konzolový program, který obsahuje rychlý algoritmus prohledávání stromu, quartet puzzling, který umožňuje analýzu rozsáhlých datových množin a automatické přiřazení jednotlivých odhadů. TREE-PUZZLE také vypočítá pravděpodobnost maximální vzdálenosti stejně jako délku větví uživatelem určených stromů. Délku větví je možno spočítat také podle časových předpokladů. Kromě toho, TREE-PUZZLE nabízí novou metodu, pravděpodobnostní mapování, sloužící k vyšetření hypotézy interní větve bez nutnosti vypočítání celého stromu a také k vizualizaci fylogenetického obsahu a sekvenčního uspořádání.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to tree-puzzle

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Package not available

Download tree-puzzle

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	161.4 kB	411.0 kB	[list of files]