Package: apbs (1.4-1 and others)

[ Source: apbs  ]

Adaptive Poisson Boltzmann Solver

APBS je softwarový balíček pro numerické řešení Poisson-Boltzmannovy rovnice (PBE), jednoho z nejpopulárnějších modelů kontinua sloužícího k popisu elektrostatických iterací mezi molekulami rozpuštěnými ve slaném vodním roztoku. Elektrostatické kontinuum hraje velmi důležitou roli v různých oblastech biomolekulárních simulací, včetně:

  * simulací difúzního procesu pro určení kinetických vztahů ligand-protein
    a protein-protein,
  * implicitní řešitel molekulární dynamiky biomolekul,
  * řešení energetických výpočtů sloužících ke stanovení rovnovážných 
    konstant vazeb ligand-protein a protein-protein, jejichž hodnota je
    důležitá při vytváření léků
  * a biomolekulární titrační studie.

APBS byl vytvořen tak, aby efektivně vyhodnotil elektrostatické vlastnosti v takových simulacích, které pokrývají rozsáhlé studie zaměřené na výzkum molekul ve vztahu k desítkám miliónů atomů.

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility

Other Packages Related to apbs

• dep: libc6 (>= 2.14)

  Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libmaloc1 (>= 0.2-1)

  Object-oriented Abstraction Layer for C

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimační knihovna - runtime

Download apbs

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.4-1+b1	213.4 kB	617.0 kB	[list of files]