Package: gromacs (2020.6-2)

[ Source: gromacs  ]

Simulátor molekulární dynamiky, s nástroji pro sestavování a analýzu

GROMACS je víceúčelový balíček pro molekulární dynamiku, tedy simulace pohybu podle Newtonovských rovnic na systémech stovek až milionů částic.

Je primárně navržen pro biochemické molekuly jako jsou bílkoviny nebo lipidy, které mají mnoho komplikovaných vazebních interakcí, ale protože je GROMACS velmi rychlý i při počítání nevazebních interakcí (které většinou dominují v simulaci) je používán i pro výzkum nebiologických systémů, např. polymerů.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::graphical, interface::x11, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Other Packages Related to gromacs

• dep: gromacs-data (= 2020.6-2)

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  Knihovna pro překladač GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgromacs5 (>= 2020.6)

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libx11-6

  X11 client-side library

• dep: neon-support [armhf]

  prevent installation on processors without required instructions

• dep: sse2-support [i386]

  prevent installation on processors without required instructions

• dep: sse4.2-support [amd64]

  prevent installation on processors without required instructions

• rec: cpp

  GNU C preprocessor (cpp)

• sug: pymol

  Molecular Graphics System

Download gromacs

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	133.9 kB	523.0 kB	[list of files]
arm64	130.9 kB	499.0 kB	[list of files]
armel	122.6 kB	451.0 kB	[list of files]
armhf	118.5 kB	375.0 kB	[list of files]
i386	133.0 kB	511.0 kB	[list of files]
mips64el	136.3 kB	585.0 kB	[list of files]
mipsel	141.4 kB	545.0 kB	[list of files]
ppc64el	140.8 kB	603.0 kB	[list of files]
s390x	120.3 kB	523.0 kB	[list of files]