Пакет: r-bioc-titancna (1.42.0-1)

[ Източник: r-bioc-titancna  ]

Subclonal copy number and LOH prediction from whole genome sequencing

Hidden Markov model to segment and predict regions of subclonal copy number alterations (CNA) and loss of heterozygosity (LOH), and estimate cellular prevalence of clonal clusters in tumour whole genome sequencing data.

Други пакети, свързани с r-bioc-titancna

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [mips64el, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

• dep: r-api-4.0

  виртуален пакет, предлаган от r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  виртуален пакет, предлаган от r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.50.0)

  BioConductor annotation of genetic variants

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  GNU R extension of Data.frame

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.5.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  GNU R foreach looping support

Изтегляне на r-bioc-titancna

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	3 819,3 кБ	7 622,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3 819,8 кБ	7 666,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	3 818,0 кБ	7 667,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3 818,4 кБ	7 666,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	3 817,4 кБ	7 614,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	3 820,3 кБ	7 622,0 кБ	[списък на файловете]