Пакет: r-bioc-decontam (1.24.0+dfsg-1)

[ Източник: r-bioc-decontam  ]

identify contaminants in marker-gene and metagenomics sequencing sata

Simple statistical identification of contaminating sequence features in marker-gene or metagenomics data. Works on any kind of feature derived from environmental sequencing data (e.g. ASVs, OTUs, taxonomic groups, MAGs,...). Requires DNA quantitation data or sequenced negative control samples.

Други пакети, свързани с r-bioc-decontam

• dep: r-api-4.0

  виртуален пакет, предлаган от r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  виртуален пакет, предлаган от r-bioc-biocgenerics

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-phyloseq

  Пакетът не е наличен

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

Изтегляне на r-bioc-decontam

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
all	205,8 кБ	285,0 кБ	[списък на файловете]