всички настройки
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Източник: python-pyfaidx  ]

Пакет: python3-pyfaidx (0.8.1.3-1)

Връзки за python3-pyfaidx

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник python-pyfaidx.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

efficient random access to fasta subsequences for Python 3

Samtools provides a function "faidx" (FAsta InDeX), which creates a small flat index file ".fai" allowing for fast random access to any subsequence in the indexed FASTA file, while loading a minimal amount of the file in to memory. This Python module implements pure Python classes for indexing, retrieval, and in-place modification of FASTA files using a samtools compatible index. The pyfaidx module is API compatible with the pygr seqdb module. A command-line script "faidx" is installed alongside the pyfaidx module, and facilitates complex manipulation of FASTA files without any programming knowledge.

This package provides the Python 3 modules to access fasta files.

Други пакети, свързани с python3-pyfaidx

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на python3-pyfaidx

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
all 28,4 кБ125,0 кБ [списък на файловете]