Пакет: bowtie2 (2.5.4-1)
Връзки за bowtie2
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник bowtie2.
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Alexandre Mestiashvili (Страница за QA)
- Andreas Tille (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [bowtie-bio.sourceforge.net]
Подобни пакети:
ultrafast memory-efficient short read aligner
is an ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads to long reference sequences. It is particularly good at aligning reads of about 50 up to 100s or 1,000s of characters, and particularly good at aligning to relatively long (e.g. mammalian) genomes.
Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index to keep its memory footprint small: for the human genome, its memory footprint is typically around 3.2 GB. Bowtie 2 supports gapped, local, and paired-end alignment modes
Други пакети, свързани с bowtie2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- compression library - runtime
-
- sug: bowtie2-examples
- Examples for bowtie2
Изтегляне на bowtie2
Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|
amd64 | 1 474,7 кБ | 5 936,0 кБ | [списък на файловете] |