Пакет: libjellyfish-2.0-2 (2.3.0-10)

[ Източник: jellyfish  ]

count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.

Етикети: Role: Shared Library

Други пакети, свързани с libjellyfish-2.0-2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [не armel, armhf]

Изтегляне на libjellyfish-2.0-2

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	63,6 кБ	198,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	59,5 кБ	189,0 кБ	[списък на файловете]
armel	55,5 кБ	165,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	55,9 кБ	137,0 кБ	[списък на файловете]
i386	70,1 кБ	197,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	60,6 кБ	226,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	69,0 кБ	286,0 кБ	[списък на файловете]