Пакет: unifrac-tools (1.2-2)

[ Източник: unifrac-tools  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

Други пакети, свързани с unifrac-tools

• dep: libblas3

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  или libblas.so.3

  виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [не amd64, armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: liblapacke (>= 3.11.0)

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

  Fast LZ compression algorithm library - runtime

• dep: libssu0

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libsz2 (>= 1.0.6)

  Adaptive Entropy Coding library - SZIP

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на unifrac-tools

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1 532,0 кБ	7 564,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1 341,0 кБ	8 124,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1 408,9 кБ	9 010,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1 363,8 кБ	5 944,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1 382,2 кБ	9 538,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1 137,1 кБ	8 491,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	1 232,2 кБ	9 449,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1 340,4 кБ	9 724,0 кБ	[списък на файловете]