Пакет: tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-9)

[ Източник: tree-puzzle  ]

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood

TREE-PUZZLE (the new name for PUZZLE) is an interactive console program that implements a fast tree search algorithm, quartet puzzling, that allows analysis of large data sets and automatically assigns estimations of support to each internal branch. TREE-PUZZLE also computes pairwise maximum likelihood distances as well as branch lengths for user specified trees. Branch lengths can also be calculated under the clock-assumption. In addition, TREE-PUZZLE offers a novel method, likelihood mapping, to investigate the support of a hypothesized internal branch without computing an overall tree and to visualize the phylogenetic content of a sequence alignment.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Други пакети, свързани с tree-puzzle

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Пакетът не е наличен

Изтегляне на tree-puzzle

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	167,7 кБ	405,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	155,3 кБ	380,0 кБ	[списък на файловете]
armel	160,0 кБ	408,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	151,1 кБ	300,0 кБ	[списък на файловете]
i386	178,5 кБ	484,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	166,7 кБ	468,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	166,4 кБ	449,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	176,1 кБ	493,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	153,9 кБ	408,0 кБ	[списък на файловете]