Пакет: libtfbs-perl (0.7.1+ds-2 и други)
Връзки за libtfbs-perl
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник libtfbs-perl.
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds-2.dsc]
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds.orig.tar.xz]
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds-2.debian.tar.xz]
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Steffen Moeller (Страница за QA)
- Charles Plessy (Страница за QA)
- Andreas Tille (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [tfbs.genereg.net]
Подобни пакети:
scanning DNA sequence with a position weight matrix
The TFBS perl modules comprise a set of routines to interact with the Transfac and Jaspar databases that describe a special family of proteins, the transcription factors. These bind to genomic DNA to initiate (or prevent) the readout of a gene. Once multiple binding sites are known for a transcription factor, these are gathered in a single file and are aligned in order to find position-specific characteristica that might be used to predict such binding events in novel DNA sequences.
If you use TFBS in your work, please cite "Lenhard B., Wasserman W.W. (2002) TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. Bioinformatics 18:1135-1136".
Note: the TFBS perl module is no longer under active development. All the functionality can be found in the TFBSTools Bioconductor package; users are highly encouraged to switch. <http://bioconductor.org/packages/TFBSTools/>
Други пакети, свързани с libtfbs-perl
|
|
|
|
-
- dep: bioperl
- Perl tools for computational molecular biology
-
- dep: libc6 (>= 2.7)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libdbi-perl
- Perl Database Interface (DBI)
-
- dep: libwww-perl
- simple and consistent interface to the world-wide web
-
- dep: pdl (>= 1:2.080-3+b1)
- perl data language: Perl extensions for numerics
-
- dep: perl (>= 5.36.0-4)
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- dep: perlapi-5.36.0
- виртуален пакет, предлаган от perl-base
-
- rec: libgd-gd2-perl
- виртуален пакет, предлаган от libgd-perl
- или libgd-gd2-noxpm-perl
- виртуален пакет, предлаган от libgd-perl
Изтегляне на libtfbs-perl
Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|---|
mips64el | 0.7.1+ds-2+b2 | 226,4 кБ | 1 039,0 кБ | [списък на файловете] |