软件包：maq（0.7.1-10）

[ 源代码： maq  ]

将短的、定长的多态性DNA序列读段比对到参考序列上

Maq（Mapping and Assembly with Quality的简称）是一款用于构建新一代测序仪产生 的短读序列到参考序列的比对组装工具。它特别针对Illumina-Solexa 1G基因分析仪进 行了优化设计，并具备初步处理ABI SOLiD数据的功能。Maq曾被称为mapass2。

Maq的开发在2008年停止，其后继者为BWA和SAMtools。

标签: 领域: 生物学, 生物信息学, 实做语言: implemented-in::c++, implemented-in::perl, 用户接口: 命令行, 角色: role::program, scope::utility, Purpose: 需要一个额外的标签, Analysing, use::comparing, use::searching, 支持的格式: 需要一个额外的标签, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

其他与 maq 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC 支持库

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU 标准 C++ 库，第3版

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  压缩库 - 运行时

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

下载 maq

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	软件包大小	安装后大小	文件
mips64el	296.6 kB	588.0 kB	[文件列表]