软件包：unifrac-tools（1.4-3 以及其他的）

[ 源代码： unifrac-tools  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

其他与 unifrac-tools 有关的软件包

• dep: libblas3

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  或者 libblas.so.3

  本虚包由这些包填实： libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [除 ia64]

  简单易用的客户端 URL 传输软件库（OpenSSL 变种）

• dep: libgcc-s1 (>= 11) [arm64]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 12) [amd64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP（GOMP）支持库

• dep: liblapacke (>= 3.12.0)

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

  快速 LZ 压缩算法库 - 运行时

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [除 ia64]

  安全套接字层工具箱 - 共享库

• dep: libssu0

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 14) [除 ia64, m68k]

• dep: libsz2 (>= 1.1.3)

  Adaptive Entropy Coding library - SZIP

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ia64]

  压缩库 - 运行时

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.0) [除 ia64]

下载 unifrac-tools

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	1.4-3+b2	1,361.5 kB	9,214.0 kB	[文件列表]
amd64	1.4-3+b4	1,738.8 kB	8,540.0 kB	[文件列表]
arm64	1.4-3+b4	1,506.4 kB	9,077.0 kB	[文件列表]
armel	1.4-3+b4	1,555.5 kB	9,556.0 kB	[文件列表]
armhf	1.4-3+b4	1,519.9 kB	6,504.0 kB	[文件列表]
i386	1.4-3+b4	1,646.3 kB	10,274.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	1.4-3+b1	1,507.2 kB	15,977.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	1.4-3+b3	1,102.6 kB	7,611.0 kB	[文件列表]
mips64el	1.4-3+b4	1,347.0 kB	9,510.0 kB	[文件列表]
ppc64el	1.4-3+b4	1,509.5 kB	10,356.0 kB	[文件列表]
riscv64	1.4-3+b4	1,824.5 kB	7,629.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	1.4-3+b3	1,390.1 kB	6,952.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	1.4-3+b3	1,594.5 kB	8,144.0 kB	[文件列表]