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软件包:clustalx(2.1+lgpl-9 以及其他的) [debports]

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核酸序列或蛋白质序列的多序列比对程序(图形界面)

该软件包为 Clustal 多序列比对程序提供了一个图形用户界面。它为多序列比对、分析比对结果提供了 一个集成的环境。序列比对结果会显示在屏幕的一个窗口里。在比对中会用多种颜色条来标注出保守区域。 对于专业演示,可以使用 texshade LaTeX 或 boxshade 来着色。

窗口顶部有下拉菜单,您可以从中选择所有传统的多序列比对所需的选项、参数等。您还可以通过复制、 粘贴序列来改变比对的顺序;您可以从中选择一部分序列做另外的比对;您还可以选择比对区段的一部分 重新进行比对,并插入到原始的比对文件中去!

此外,您还可以进行比对质量的分析,并用高亮标注出得分低的区段或异常的位点。

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