软件包:clustalx(2.1+lgpl-9 以及其他的) [debports]
核酸序列或蛋白质序列的多序列比对程序(图形界面)
该软件包为 Clustal 多序列比对程序提供了一个图形用户界面。它为多序列比对、分析比对结果提供了 一个集成的环境。序列比对结果会显示在屏幕的一个窗口里。在比对中会用多种颜色条来标注出保守区域。 对于专业演示,可以使用 texshade LaTeX 或 boxshade 来着色。
窗口顶部有下拉菜单,您可以从中选择所有传统的多序列比对所需的选项、参数等。您还可以通过复制、 粘贴序列来改变比对的顺序;您可以从中选择一部分序列做另外的比对;您还可以选择比对区段的一部分 重新进行比对,并插入到原始的比对文件中去!
此外,您还可以进行比对质量的分析,并用高亮标注出得分低的区段或异常的位点。
其他与 clustalx 有关的软件包
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- dep: libc6.1 (>= 2.34)
- GNU C 语言运行库:共享库
同时作为一个虚包由这些包填实: libc6.1-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC 支持库
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- dep: libqt5core5t64 (>= 5.7.0)
- Qt 5 核心模块
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- dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0)
- Qt 5 GUI module
- 或者 libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)
- Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
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- dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2)
- Qt 5 widgets 模块
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- dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2)
- Qt 5 XML module
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 标准 C++ 库,第3版
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- sug: boxshade
- Pretty-printing of multiple sequence alignments
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- sug: clustalw
- global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
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- sug: texlive-latex-extra
- TeX Live: LaTeX additional packages