[ 源代码： sga ]
软件包：sga（0.10.15-4）
使用字符串图的 de novo 基因组组装器
SGA 的主要目标是实现高效的内存使用，这通过对 DNA 序列读段进行压缩表示来实现。
SGA 是一个用于 DNA 序列读段的 de novo 组装器。它基于 Gene Myers 提出的字符串图（string graph）组装方法，并利用 FM 索引/Burrows-Wheeler 变换高效地查找序列读段之间的重叠关系。
其他与 sga 有关的软件包
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- dep: libbamtools2.5.1
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
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- dep: libc6 (>= 2.23)
- GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC 支持库
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP（GOMP）支持库
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 标准 C++ 库，第3版
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- dep: python
- 交互式高级面向对象语言（Python2 版本）
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- dep: python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
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- dep: python-ruffus
- Python computation pipeline library widely used in bioinformatics
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- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 压缩库 - 运行时
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- rec: abyss (>= 2.0.2-1)
- de novo, parallel, sequence assembler for short reads