[ 源代码: placnet ]
软件包:placnet(1.03-3)
质粒星座网络(Plasmid Constellation Network)项目
Placnet 是一个用于 NGS 项目中的质粒分析的新工具。Placnet 经过优化,可用于 Illumina 序列,同时也兼容 454、Iontorrent 或其他当前的测序技术。
Placnet 的输入是一个包含多个 contig 的集合,以及一个或多个 SAM 文件,这些文件包含读段(reads)对 contig 的比对信息。Placnet 生成一组文件,可方便地在 Cytoscape 软件或其他网络分析工具中打开和使用。
其他与 placnet 有关的软件包
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- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools