Пакунок: maqview (0.2.5-12)

[ Source: maqview  ]

graphical read alignment viewer for short gene sequences

Maqview is graphical read alignment viewer. It is specifically designed for the Maq alignment file and allows you to see the mismatches, base qualities and mapping qualities. Maqview is nothing fancy as Consed or GAP, but just a simple viewer for you to see what happens in a particular region.

In comparison to tgap-maq, the text-based read alignment viewer written by James Bonfield, Maqview is faster and takes up much less memory and disk space in indexing. This is possibly because tgap aims to be a general-purpose viewer but Maqview fully makes use of the fact that a Maq alignment file has already been sorted. Maqview is also efficient in viewing and provides a command-line tool to quickly retrieve any region in an Maq alignment file.

Інші пакунки пов'язані з maqview

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgl1

  Vendor neutral GL dispatch library -- legacy GL support

• dep: libglu1-mesa

  Допоміжна бібліотека Mesa OpenGL (GLU)

  or libglu1

  virtual package provided by libglu1-mesa

• dep: libglut3.12 (>= 3.4.0)

  Допоміжний інструментарій OpenGL

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

Завантажити maqview

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	116.6 kB	904.0 kB	[список файлів]
arm64	109.6 kB	953.0 kB	[список файлів]
armel	98.9 kB	772.0 kB	[список файлів]
armhf	99.1 kB	660.0 kB	[список файлів]
i386	125.3 kB	908.0 kB	[список файлів]
mips64el	116.5 kB	1,114.0 kB	[список файлів]
ppc64el	124.0 kB	1,144.0 kB	[список файлів]
riscv64	120.0 kB	785.0 kB	[список файлів]
s390x	117.4 kB	932.0 kB	[список файлів]