Пакунок: porechop (0.2.4+dfsg-6)

[ Source: porechop  ]

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Інші пакунки пов'язані з porechop

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3~)

Завантажити porechop

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
armhf	51.2 kB	205.0 kB	[список файлів]