Пакунок: phybin (0.3-6)

[ Source: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Інші пакунки пов'язані з phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  Підтримка бібліотеки, яка забезпечує вбудовані функції __atomic

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Бібліотека інтерфейсу до сторонніх функцій — виконавчі файли

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1)

  Арифметична бібліотека багатоточності

Завантажити phybin

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
armel	4,407.2 kB	28,552.0 kB	[список файлів]