Пакунок: ncbi-entrez-direct (19.2.20230331+dfsg-3 and others)

[ Source: ncbi-entrez-direct  ]

NCBI Entrez utilities on the command line

Entrez Direct (EDirect) is an advanced method for accessing NCBI's set of interconnected databases (publication, sequence, structure, gene, variation, expression, etc.) from a terminal window or script. Functions take search terms from command-line arguments. Individual operations are combined to build multi-step queries. Record retrieval and formatting normally complete the process.

EDirect also provides an argument-driven function that simplifies the extraction of data from document summaries or other results that are returned in structured XML format. This can eliminate the need for writing custom software to answer ad hoc questions. Queries can move seamlessly between EDirect commands and UNIX utilities or scripts to perform actions that cannot be accomplished entirely within Entrez.

Інші пакунки пов'язані з ncbi-entrez-direct

• dep: curl

  Інструмент командного рядка для передачі даних за синтаксисом URL

  or wget

  Отримання файлів з Інтернет

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• rec: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: curl

  Інструмент командного рядка для передачі даних за синтаксисом URL

• sug: libxml-simple-perl

  Perl module for reading and writing XML

• sug: libxml2-utils

  GNOME XML library - utilities

• sug: perl

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

• sug: unzip

  Розпакувальник файлів .zip

Завантажити ncbi-entrez-direct

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
armel	19.2.20230331+dfsg-3+b3	5,354.2 kB	26,174.0 kB	[список файлів]