[ Source: mafft ]
Пакунок: mafft (7.505-1)
Links for mafft
Debian Resources:
Download Source Package mafft:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [mafft.cbrc.jp]
Similar packages:
Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
MAFFT is a multiple sequence alignment program which offers three accuracy-oriented methods:
* L-INS-i (probably most accurate; recommended for <200 sequences; iterative refinement method incorporating local pairwise alignment information), * G-INS-i (suitable for sequences of similar lengths; recommended for <200 sequences; iterative refinement method incorporating global pairwise alignment information), * E-INS-i (suitable for sequences containing large unalignable regions; recommended for <200 sequences),and five speed-oriented methods:
* FFT-NS-i (iterative refinement method; two cycles only), * FFT-NS-i (iterative refinement method; max. 1000 iterations), * FFT-NS-2 (fast; progressive method), * FFT-NS-1 (very fast; recommended for >2000 sequences; progressive method with a rough guide tree), * NW-NS-PartTree-1 (recommended for ∼50,000 sequences; progressive method with the PartTree algorithm).
Інші пакунки пов'язані з mafft
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- rec: blast2
- Пакунок недоступний
-
- rec: libwww-perl
- Простий й послідовний програмний інтерфейс до всесвітнього павутиння
-
- rec: lynx
- класичний неграфічний (текстовий) вебоглядач
-
- rec: ruby
- Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)
-
- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
Завантажити mafft
Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|
amd64 | 1,052.5 kB | 11,920.0 kB | [список файлів] |