Пакунок: libbio-samtools-perl (1.43-5 and others)

[ Source: libbio-samtools-perl  ]

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Tags: Software Development: Perl Development, Бібліотеки, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Development Library, Shared Library

Інші пакунки пов'язані з libbio-samtools-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: perl (>= 5.40.0-6)

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

• dep: perlapi-5.40.0

  virtual package provided by perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

• enh: gbrowse

  GMOD Generic Genome Browser

• enh: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Завантажити libbio-samtools-perl

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
s390x	1.43-5+b1	171.4 kB	607.0 kB	[список файлів]