[ Source: perm ]
Пакунок: perm (0.4.0-8 and others)
efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds
PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.
Інші пакунки пов'язані з perm
|
|
|
|
-
- dep: libbsd0 (>= 0.0)
- Інструментальні функції з систем BSD — колективна бібліотека
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
Завантажити perm
Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|---|
armhf | 0.4.0-8+b1 | 111.8 kB | 284.0 kB | [список файлів] |