Пакунок: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3)

[ Source: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Інші пакунки пов'язані з sprai

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

• dep: time

  Програма GNU Time для вимірювання використання ресурсів ЦП

• sug: make

  Утиліта управління компіляцією

• sug: pbalign

  Пакунок недоступний

• sug: pbgenomicconsensus

  Пакунок недоступний

• sug: pbh5tools

  Пакунок недоступний

Завантажити sprai

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
armel	1,473.0 kB	1,693.0 kB	[список файлів]