Пакунок: python-pbgenomicconsensus (2.3.2-5)

[ Source: pbgenomicconsensus  ]

Pacific Biosciences variant and consensus caller (Python 2)

The GenomicConsensus package provides Quiver, Pacific Biosciences' flagship consensus and variant caller. Quiver is an algorithm that finds the maximum likelihood template sequence given PacBio reads of the template. These reads are modeled using a conditional random field approach that prescribes a probability to a read given a template sequence. In addition to the base sequence of each read, Quiver uses several additional quality value covariates that the base caller provides.

This package is part of the SMRTAnalysis suite and provides the Python 2 backend library.

Інші пакунки пов'язані з python-pbgenomicconsensus

• dep: python

  Інтерактивна об'єктно-орієнтована мова високого рівня (гілка 2.x)

• dep: python-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)

• dep: python-numpy

  Швидкі методи для роботи з числовими масивами (модуль для Python)

• dep: python-pbcommand

  common command-line interface for Pacific Biosciences analysis modules

• dep: python-pbconsensuscore

  algorithms for PacBio multiple sequence consensus -- Python 2

• dep: python-pbcore

  Python 2 library for processing PacBio data files

• sug: python-consensuscore2

  generate consensus sequences for PacBio data -- Python 2

Завантажити python-pbgenomicconsensus

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
all	46.1 kB	265.0 kB	[список файлів]