Пакунок: ltrsift (1.0.2-8)

[ Source: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Comparing, Data Organisation, use::viewing, x11::application

Інші пакунки пов'язані з ltrsift

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  ATK — інструментарій доступності для людей з особливими потребами

• dep: libc6 (>= 2.7)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D — бібліотека векторної графіки

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  Загальна бібліотека налаштування шрифтів — підтримка виконання

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  Шрифтовий рушій FreeType 2, файли бібліотеки загального користування

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  Бібліотека GDK Pixbuf

• dep: libgenometools0

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  Glib бібліотека алгоритмів на Сі

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)

  Бібліотека графічного користувацького інтерфейсу GTK+

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Форматування та відтворення інтернаціоналізованого тексту

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Форматування та відтворення інтернаціоналізованого тексту

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Форматування та відтворення інтернаціоналізованого тексту

• rec: last-align

  genome-scale comparison of biological sequences

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Завантажити ltrsift

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
i386	119.1 kB	447.0 kB	[список файлів]