Пакунок: arden (1.0-5)

[ Source: arden  ]

specificity control for read alignments using an artificial reference

ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data) is a novel benchmark that estimates error rates based on real experimental reads and an additionally generated artificial reference genome. It allows the computation of error rates specifically for a dataset and the construction of a ROC-curve. Thereby, it can be used to optimize parameters for read mappers, to select read mappers for a specific problem or also to filter alignments based on quality estimation.

Інші пакунки пов'язані з arden

• dep: python3

  Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)

• dep: python3-htseq

  Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

• dep: python3-matplotlib

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• dep: python3-numpy

  Швидкі методи для роботи з числовими масивами для мови Python 3

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

Завантажити arden

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
all	87.2 kB	1,156.0 kB	[список файлів]