Пакунок: qcat (1.1.0-2)

[ Source: qcat  ]

demultiplexing Oxford Nanopore reads from FASTQ files

Qcat is a command-line tool for demultiplexing Oxford Nanopore reads from FASTQ files. It accepts basecalled FASTQ files and splits the reads into separate FASTQ files based on their barcode. Qcat makes the demultiplexing algorithms used in albacore/guppy and EPI2ME available to be used locally with FASTQ files. Currently qcat implements the EPI2ME algorithm.

Інші пакунки пов'язані з qcat

• dep: python3

  Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-parasail (>= 1.2-3)

  Python3 bindings for the parasail C library

• dep: python3-six

  Python 2 and 3 compatibility library (Python 3 interface)

• dep: python3-yaml

  YAML parser and emitter for Python3

• sug: qcat-examples

  demultiplexing Oxford Nanopore reads from FASTQ files (examples)

Завантажити qcat

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
all	30.3 kB	269.0 kB	[список файлів]