Пакунок: readucks (0.0.3-2)

[ Source: readucks  ]

Nanopore read de-multiplexer (read demux -> readux -> readucks, innit)

This package is inspired by the demultiplexing options in porechop but without the adapter trimming options - it just demuxes. It uses the parasail library with its Python bindings to do pairwise alignment which provides a considerable speed up over the seqan library used by porechop due to its low-level use of vector processor instructions.

Інші пакунки пов'язані з readucks

• dep: python3

  Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-parasail

  Python3 bindings for the parasail C library

Завантажити readucks

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
all	19.8 kB	107.0 kB	[список файлів]