Пакунок: macsyfinder (2.0~rc1-3 and others)

[ Source: macsyfinder  ]

detection of macromolecular systems in protein datasets

MacSyFinder is a program to model and detect macromolecular systems, genetic pathways... in protein datasets. In prokaryotes, these systems have often evolutionarily conserved properties: they are made of conserved components, and are encoded in compact loci (conserved genetic architecture). The user models these systems with MacSyFinder to reflect these conserved features, and to allow their efficient detection

This package presents the Open Source Java API to biological databases and a series of mostly sequence-based algorithms.

Інші пакунки пов'язані з macsyfinder

• dep: hmmer

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis

• dep: libjs-jquery

  JavaScript library for dynamic web applications

• dep: libjs-sphinxdoc (>= 2.4.3-5~)

  JavaScript support for Sphinx documentation

• dep: libjs-underscore

  JavaScript's functional programming helper library

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: python3

  Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)

• dep: python3-colorlog

  formatter to use with the logging module of Python 3

• dep: python3-networkx

  tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)

• dep: python3-packaging

  основні утиліти для пакунків python3

• dep: python3-yaml

  YAML parser and emitter for Python3

• dep: sphinx-rtd-theme-common (>= 0.5.1+dfsg)

  sphinx theme from readthedocs.org (common files)

Завантажити macsyfinder

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
i386	2.0~rc1-3+b1	11,319.0 kB	33,920.0 kB	[список файлів]