Пакунок: sibsim4 (0.20-5)

[ Source: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Інші пакунки пов'язані з sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

Завантажити sibsim4

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
armel	27.5 kB	72.0 kB	[список файлів]