Пакунок: tophat-recondition (1.4-3)

Links for tophat-recondition

Debian Resources:

Download Source Package tophat-recondition:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

post-processor for TopHat unmapped reads

tophat-recondition is a post-processor for TopHat unmapped reads (contained in unmapped.bam), making them compatible with downstream tools (e.g., the Picard suite, samtools, GATK) (TopHat issue #17). It also works around bugs in TopHat:

 * the "mate is unmapped" SAM flag is not set on any reads in the
   unmapped.bam file (TopHat issue #3)
 * the mapped mate of an unmapped read can be absent from
   accepted_hits.bam, creating a mismatch between the file and the unmapped
   read's flags (TopHat issue #16)

Інші пакунки пов'язані з tophat-recondition

depends

recommends

suggests

enhances

dep: python3

Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)

sug: tophat2

Пакунок недоступний

Завантажити tophat-recondition

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
all	10.9 kB	36.0 kB	[список файлів]