Пакунок: perm (0.4.0-8 and others)

[ Source: perm  ]

efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds

PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.

Інші пакунки пов'язані з perm

• dep: libbsd0 (>= 0.0)

  Інструментальні функції з систем BSD — колективна бібліотека

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el, mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

Завантажити perm

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	0.4.0-8+b1	124.4 kB	337.0 kB	[список файлів]
arm64	0.4.0-8+b1	112.9 kB	349.0 kB	[список файлів]
armel	0.4.0-8+b1	108.0 kB	348.0 kB	[список файлів]
armhf	0.4.0-8+b1	111.8 kB	284.0 kB	[список файлів]
i386	0.4.0-8+b1	141.8 kB	392.0 kB	[список файлів]
mips64el	0.4.0-8+b1	127.2 kB	502.0 kB	[список файлів]
mipsel	0.4.0-8+b1	131.4 kB	498.0 kB	[список файлів]
ppc64el	0.4.0-8+b1	132.1 kB	477.0 kB	[список файлів]
s390x	0.4.0-8+b1	113.2 kB	345.0 kB	[список файлів]