Пакунок: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-10)

[ Source: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Tags: Role: Shared Library

Інші пакунки пов'язані з libfastahack0

• dep: libc6 (>= 2.33)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

Завантажити libfastahack0

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	25.1 kB	83.0 kB	[список файлів]
arm64	23.2 kB	87.0 kB	[список файлів]
armel	23.3 kB	81.0 kB	[список файлів]
armhf	23.7 kB	81.0 kB	[список файлів]
i386	27.7 kB	81.0 kB	[список файлів]
mips64el	24.3 kB	90.0 kB	[список файлів]
mipsel	25.3 kB	83.0 kB	[список файлів]
ppc64el	26.4 kB	151.0 kB	[список файлів]
s390x	22.8 kB	73.0 kB	[список файлів]