Пакунок: concavity (0.1+dfsg.1-5)

[ Source: concavity  ]

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

Інші пакунки пов'язані з concavity

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• sug: conservation-code

  protein sequence conservation scoring tool

• sug: pymol

  Графічна система відтворення молекул

Завантажити concavity

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	238.5 kB	973.0 kB	[список файлів]
arm64	224.0 kB	941.0 kB	[список файлів]
armel	224.9 kB	933.0 kB	[список файлів]
armhf	222.9 kB	809.0 kB	[список файлів]
i386	252.5 kB	1,020.0 kB	[список файлів]
mips64el	252.7 kB	1,168.0 kB	[список файлів]
mipsel	259.2 kB	1,112.0 kB	[список файлів]
ppc64el	252.8 kB	1,130.0 kB	[список файлів]
s390x	224.1 kB	969.0 kB	[список файлів]