Paket: lagan (2.0-10)

[ Källkod: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andra paket besläktade med lagan

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta lagan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
riscv64	180,8 kbyte	682,0 kbyte	[filförteckning]