Paket: cassiopee (1.0.9-4 och andra) [debports]

[ Källkod:  ]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

Andra paket besläktade med cassiopee

• dep: libc6.1 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

• dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)

  library implementating search algorithms

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC stödbibliotek

• dep: libgoogle-glog0v6t64 (>= 0.6.0)

  library that implements application-level logging.

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta cassiopee

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.0.9-4+b1	16,6 kbyte	155,0 kbyte	[filförteckning]