Paket: r-bioc-pwalign (1.2.0-1) [debports]

[ Källkod:  ]

Experimentellt paket

Varning: Paketet är från den experimentella utgåvan. Det innebär att det med stor sannolikhet är instabilt eller innehåller fel, och kanske till och med kan orsaka dataförluster. Se till att läsa ändringsloggen och annan dokumentation innan du använder det.

Perform pairwise sequence alignments

The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.

Andra paket besläktade med r-bioc-pwalign

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuellt paket som tillhandahålls av r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.71.5)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Hämta r-bioc-pwalign

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
sparc64 (inofficiell anpassning)	732,3 kbyte	2.042,0 kbyte	[filförteckning]