Paket: r-bioc-dnacopy (1.80.0-1)

[ Källkod: r-bioc-dnacopy  ]

Experimentellt paket

Varning: Paketet är från den experimentella utgåvan. Det innebär att det med stor sannolikhet är instabilt eller innehåller fel, och kanske till och med kan orsaka dataförluster. Se till att läsa ändringsloggen och annan dokumentation innan du använder det.

R package: DNA copy number data analysis

Implements the circular binary segmentation (CBS) algorithm to segment DNA copy number data and identify genomic regions with abnormal copy number.

This package is for analyzing array DNA copy number data, which is usually (but not always) called array Comparative Genomic Hybridization (array CGH) data It implements a methodology for finding change-points in these data which are points after which the (log) test over reference ratios have changed location. This model is that the change-points correspond to positions where the underlying DNA copy number has changed. Therefore, change-points can be used to identify regions of gained and lost copy number. Also provided is a function for making relevant plots of these data.

Andra paket besläktade med r-bioc-dnacopy

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgfortran5 (>= 10)

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: r-api-4.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuellt paket som tillhandahålls av r-bioc-biocgenerics

Hämta r-bioc-dnacopy

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
mips64el	485,6 kbyte	622,0 kbyte	[filförteckning]