Paket: r-bioc-genomeinfodb (1.42.1+dfsg-1)

[ Källkod: r-bioc-genomeinfodb  ]

Experimentellt paket

Varning: Paketet är från den experimentella utgåvan. Det innebär att det med stor sannolikhet är instabilt eller innehåller fel, och kanske till och med kan orsaka dataförluster. Se till att läsa ändringsloggen och annan dokumentation innan du använder det.

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

This package contains BioConductor utilities for manipulating chromosome and other 'seqname' identifiers.

The Seqnames package contains data and functions that define and allow translation between different chromosome sequence naming conventions (e.g., "chr1" versus "1"), including a function that attempts to place sequence names in their natural, rather than lexicographic, order.

Andra paket besläktade med r-bioc-genomeinfodb

• dep: r-api-4.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuellt paket som tillhandahålls av r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodbdata

  BioConductor species and taxonomy ID look up tables

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.25.12)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-ucsc.utils

  Low-level utilities to retrieve data from the UCSC Genome Browser

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-bsgenome

  BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages

• sug: r-bioc-genomicalignments

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• sug: r-bioc-rsamtools

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

• sug: r-cran-data.table

  GNU R extension of Data.frame

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-r.utils

  GNU R various programming utilities

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Hämta r-bioc-genomeinfodb

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
all	3.753,8 kbyte	5.034,0 kbyte	[filförteckning]