Paket: bwa (0.7.17-8~0exp)
Länkar för bwa
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet bwa:
Ansvariga:
- Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
- Charles Plessy (QA-sida)
- Andreas Tille (QA-sida)
- Carlos Borroto (QA-sida)
- Ognyan Kulev (QA-sida)
- Michael R. Crusoe (QA-sida)
Externa resurser:
- Hemsida [bio-bwa.sourceforge.net]
Liknande paket:
Experimentellt paket
Varning: Paketet är från den experimentella utgåvan. Det innebär att det med stor sannolikhet är instabilt eller innehåller fel, och kanske till och med kan orsaka dataförluster. Se till att läsa ändringsloggen och annan dokumentation innan du använder det.
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Andra paket besläktade med bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
-
- rec: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Hämta bwa
Arkitektur | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
---|---|---|---|
amd64 | 207,2 kbyte | 452,0 kbyte | [filförteckning] |