Paket: r-bioc-hsmmsinglecell (1.26.0-1)

[ Källkod: r-bioc-hsmmsinglecell  ]

Experimentellt paket

Varning: Paketet är från den experimentella utgåvan. Det innebär att det med stor sannolikhet är instabilt eller innehåller fel, och kanske till och med kan orsaka dataförluster. Se till att läsa ändringsloggen och annan dokumentation innan du använder det.

Single-cell RNA-Seq for differentiating human skeletal muscle myoblasts

Skeletal myoblasts undergo a well-characterized sequence of morphological and transcriptional changes during differentiation. In this experiment, primary human skeletal muscle myoblasts (HSMM) were expanded under high mitogen conditions (GM) and then differentiated by switching to low-mitogen media (DM). RNA-Seq libraries were sequenced from each of several hundred cells taken over a time-course of serum- induced differentiation. Between 49 and 77 cells were captured at each of four time points (0, 24, 48, 72 hours) following serum switch using the Fluidigm C1 microfluidic system. RNA from each cell was isolated and used to construct mRNA-Seq libraries, which were then sequenced to a depth of ~4 million reads per library, resulting in a complete gene expression profile for each cell.

Andra paket besläktade med r-bioc-hsmmsinglecell

• dep: r-api-4.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuellt paket som tillhandahålls av r-bioc-biocgenerics

Hämta r-bioc-hsmmsinglecell

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
all	16.380,9 kbyte	16.441,0 kbyte	[filförteckning]