Paket: twopaco (1.0.0+dfsg-1)

[ Källkod: twopaco  ]

build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes

TwoPaCo is an implementation of the algorithm described in the paper "TwoPaCo: An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes".

This package contains two programs:

 twopaco: tool for direct construction of the compressed graph from
          multiple complete genomes
 graphdump: utility that turns output of twopaco into a text format

Andra paket besläktade med twopaco

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armhf, i386]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]

  parallelism library for C++ - runtime files

  dep: libtbb12 (>= 2021.5.0) [ej amd64]

• dep: libtbbmalloc2 (>= 2017~U7) [amd64]

  parallelism helper library for C++ - runtime files

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.5.0) [ej amd64]

Hämta twopaco

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	379,3 kbyte	1.616,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	354,2 kbyte	1.524,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	349,1 kbyte	1.139,0 kbyte	[filförteckning]
i386	414,8 kbyte	1.810,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	330,2 kbyte	1.969,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	370,0 kbyte	1.972,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	341,1 kbyte	1.644,0 kbyte	[filförteckning]