Paket: python3-pyspoa (0.0.8-3 och andra)

[ Källkod: python-pyspoa  ]

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Andra paket besläktade med python3-pyspoa

• dep: libc6 (>= 2.32)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC stödbibliotek

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: python3 (<< 3.12)

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-pybind11

  pybind11 helper module for Python 3

Hämta python3-pyspoa

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
arm64	0.0.8-3+b2	45,1 kbyte	151,0 kbyte	[filförteckning]