Balík: bio-tradis (1.4.5+dfsg2-2)

[ Zdroj: bio-tradis  ]

analyse the output from TraDIS analyses of genomic sequences

Bio-Tradis contains a set of tools to analyse the output from TraDIS analyses.

The Bio-Tradis analysis pipeline is implemented as an extensible Perl library which can either be used as is, or as a basis for the development of more advanced analysis tools.

Please note: You need to manually install BioConductor Edger which can not be distributed by Debian in recent version since it is using non-distributable code locfit.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bio-tradis

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl - základné moduly jazyka Perl

• dep: libexception-class-perl

  modul jazyka Perl, ktorý vám umožňuje deklarovať skutočné triedy výnimiek

• dep: libmoose-perl

  moderná platforma objektového systému jazyka Perl

• dep: libtext-csv-perl

  manipulátor súborov CSV (pomocou XS alebo PurePerl)

• dep: libtry-tiny-perl

  modul poskytujúci minimalistický try/catch

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: r-base-core

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-cran-getopt

  GNU R package providing command-line parsing functionality

• dep: r-cran-mass

  balík MASS pre GNU R od Venable a Ripley

• dep: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• dep: smalt

  Sequence Mapping and Alignment Tool

• dep: tabix

  generic indexer for TAB-delimited genome position files

• rec: artemis

  genome browser and annotation tool

• rec: r-bioc-edger

  Empirical analysis of digital gene expression data in R

Stiahnuť bio-tradis

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	78.5 kB	244.0 kB	[zoznam súborov]