Balík: velvet (1.2.10+dfsg1-9)
Odkazy pre velvet
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík velvet:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Charles Plessy (Stránka QA)
- Andreas Tille (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
Nucleic acid sequence assembler for very short reads
Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.
Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom velvet
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
-
- sug: velvet-example
- Example data for the Velvet sequence assembler
Stiahnuť velvet
Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|
i386 | 688.9 kB | 1,466.0 kB | [zoznam súborov] |