Balík: libbio-samtools-perl (1.43-5 a iné)

[ Zdroj: libbio-samtools-perl  ]

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Značky: Software Development: Perl Development, Knižnice, Implementované v: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Vývojová knižnica, Shared Library

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libbio-samtools-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl - základné moduly jazyka Perl

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: perl (>= 5.40.0-6)

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: perlapi-5.40.0

  virtuálny balík poskytovaný balíkom perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• enh: gbrowse

  GMOD Generic Genome Browser

• enh: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Stiahnuť libbio-samtools-perl

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
i386	1.43-5+b1	187.4 kB	621.0 kB	[zoznam súborov]