Zdrojový balík: sga (0.10.15-4)
Odkazy pre sga
Zdroje Debian:
Správcovia:
Externé zdroje:
Nasledovné binárne balíky sú zostavované z tohto zdrojového balíka:
- sga
- de novo genome assembler that uses string graphs
Ostatné balíky súvisiace s balíkom sga
-
- adep:
debhelper
(>= 11~)
- pomocné programy pre debian/rules
-
- adep:
libsparsehash-dev
- Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
-
- adep:
zlib1g-dev
- komprimačná knižnica - vývoj
- alebo
libz-dev
- virtuálny balík poskytovaný balíkom
zlib1g-dev
-
- adep:
libbamtools-dev
- C++ API for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- adep:
gawk
- GNU awk, jazyk na hľadanie a spracovanie vzoriek
-
- adep:
help2man
- automatický generátor manuálových stránok
-
- adep:
samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- adep:
python
- interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)
-
- adep:
python-ruffus
- knižnica výpočtovej linky v jazyku Python široko využívaná v bioinformatike
-
- adep:
python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)